12月4日，在阿富汗東部的賈拉拉巴德市(Jalalabad)發生一起持槍射擊事件。襲擊犯重點射殺了致力于人道支援的NGO“白沙瓦(Peshawar)會”在當地的負責人中村哲醫生(73歲)，中村醫生當場遇襲身亡。

據悉，槍擊案的目的有可能是通過殺害在當地有名的中村，以減少其他支援團體的支援，并打擊當地政府。
 

槍擊案發生后，中村的妻子、長女及“白沙瓦會”的3名相關人士共計5人前往阿富汗首都喀布爾，于12月6日在當地的醫院中與中村的遺體告別。12月7日下午，于喀布爾機場舉行的追悼儀式上，總統加尼親自為其抬棺，并送上飛機。

面對深陷苦難中的人，中村醫生在阿富汗的所作所為已經超越醫生的職務范圍，他不僅在醫療領域，在農業支援領域也積極活動。他不僅在阿富汗當地獲得了高度評價，與其有過交流的人們也對此事件表示無法理解。日本首相安倍晉三在聽聞中村哲遇難的消息后表示非常震驚，并對其表達了惋惜和敬意，雅子皇后在發表其56歲生日感言時也表達了自己的遺憾及惋惜。

12月9日上午，中村哲醫生的遺體抵達了福岡機場。住在九州的約30名出身于阿富汗的人士，以及中村醫生的支持者，在機場迎接了回到故鄉福岡的中村，并打出了寫著“沒能守護您，對不起”、“您是我們的英雄”的橫幅。在福岡縣內的大學學習經濟學的留學生(20歲)表示“我們能為中村先生做的，只有團結起來。感謝他為了阿富汗人民做出的貢獻，死而后已”。