日本內閣官房長官加藤勝信在3月1日的記者會上表示，日本駐華大使館已收到赴華日本人的意見，反映中國對部分入境人員實施肛拭子核酸檢測，導致入境人員心理上蒙受很大痛苦。

加藤稱：“我們獲知，中國對于集中隔離的對象和部分入境人員實施了肛拭子核酸檢測。日本國駐華大使館收到了部分日本人的意見，反映抵達中國后入境時接受了肛拭子檢測，并因此心理上蒙受了很大痛苦等。”

在此之上，加藤還透露：“日本大使館已向中國外交部和北京市政府相關部門提出免除對入境日本人實施肛拭子檢測的要求。目前尚未收到中方關于改變檢測方式的回復，我們將繼續對此進行交涉。”

關于對入境人員實施肛拭子核酸檢測一事，中國外交部發言人汪文斌在3月1日的記者會上表示：“中方根據疫情形勢變化，按照相關法律法規，科學動態調整相關防疫措施。”對于是否可免除此種檢測，中國外交部并未給出明確答復。

而我國的媒體報道稱，專家指出，肛拭子核酸陽性持續時間比鼻拭子和咽拭子持續時間更長，增加肛拭子采樣可提高檢出率、減少漏診等。